中國構建起目前全球最完整海洋微生物基因數據庫！
小楊 / 2024-09-11 09:55:58
百歐博偉生物：“千種海洋生物基因測序項目”暨全球海洋微生物基因庫建設及應用成果聯合發(fā)布會5日在山東青島舉行。記者從會上獲悉，華大生命科學研究院與山東大學等共同構建了目前全球最完整海洋微生物基因數據庫The Global Ocean Microbiome Catalogue(GOMC)，并從中發(fā)現大量有應用潛力的基因資源。
據華大生命科學研究院研究員范廣益介紹，GOMC是已公開海洋基因組數據庫Tara Ocean的3倍、蛋白序列庫的60倍。目前，GOMC已存儲于中國的國家基因庫生命大數據平臺，對具有應用潛力基因資源的相關研究成果已在學術期刊《自然》(Nature)上發(fā)表。
據介紹，GOMC的構建過程中，科研人員對目前已公開的近240Tb海洋微生物宏基因組數據進行了重分析。GOMC擁有超4.31萬個海洋微生物基因組和24.58億個基因序列，其中有2萬余個微生物是潛在新發(fā)現物種，近1萬個微生物是在獨特生境中首次發(fā)現。
GOMC的研究過程中，科研人員挖掘出1個具有潛在應用價值的新型Cas9編輯系統(tǒng)(Om1Cas9)，將助力中國在基因編輯工具使用上具有更多獨立性和選擇；發(fā)現10個具有顯著抗菌活性及廣譜抗菌效果的新型抗菌肽，該成果的應用或將為抗生素耐藥性難題提供新解決方案；發(fā)掘3個深海來源的高活性新型嗜鹽PET塑料降解酶，或將助力實現PET塑料的綠色低碳可持續(xù)利用。
據悉，GOMC是中國(山東)自貿試驗區(qū)青島片區(qū)與華大生命科學研究院所屬青島華大基因研究院共同開展的“千種海洋生物基因測序項目”重要組成部分。“千種海洋生物基因測序項目”主要內容為海洋生物的基因樣本采集、高深度基因組測序等。
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