一、明確盲樣檢測目標；
首先要清楚檢測哪類微生物：
1、根據病原菌的致病部位：腸道致病菌、呼吸道致病菌等。
2、何類產品的微生物：食品中微生物、化妝品中微生物、水質中微生物等。
二、審核盲樣性狀：
根據盲樣性狀制訂檢測方案，如：液體、固體、附著于載體上、產品(食品、化妝品、水等)。
混合菌(一般為1~3株菌，不同種類，它們之間為不同比例)還是單一菌？
三、制訂檢測要點：
1、涂片染色、鏡檢：
1）、判定染色反應：革蘭氏染色、抗酸染色、芽胞染色、鞭毛染色等。
2）、菌體形態(tài)：球菌（分散狀、成堆狀、鏈狀、成雙狀）、桿菌：（長桿菌、短桿菌、粗桿菌、細桿菌、鏈桿菌、彎曲桿菌等）。
2、培養(yǎng)：
1）、根據作業(yè)指導書，選擇分離培養(yǎng)用培養(yǎng)基及增菌培養(yǎng)用培養(yǎng)基，從增菌培養(yǎng)管中挑取增菌液，進行增菌及分離培養(yǎng)。
2）、根據盲樣檢測目標、盲樣性狀、染色鏡檢等信息，選擇分離培養(yǎng)用培養(yǎng)基及增菌培養(yǎng)用培養(yǎng)基，進行增菌及分離培養(yǎng)。
3、挑取可疑菌落進行純培養(yǎng)：
參照從染色鏡檢的信息、選擇菌落等，從培養(yǎng)基上選擇不同菌落形態(tài)、色澤、光滑、濕潤程度、邊緣狀態(tài)等。進行純培養(yǎng)。
4、生物化學試驗：
根據菌落特點、染色鏡檢等信息，選擇生物化學反應試驗。
如：可疑為腸道致病菌，選擇三糖鐵培養(yǎng)基進行初篩，然后進行全面生物化學試驗等。
可疑為金黃色葡萄球菌，進行血漿凝固酶試驗等。
5、血清學試驗：
根據菌落形態(tài)、染色鏡檢、生物化學試驗等，選擇診斷血清分群、分型。
四、綜合分析：
根據菌落形態(tài)、染色鏡檢、血清學試驗、生化試驗或分子生物學檢測等，判定盲樣中微生物的種類名稱。
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