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標準菌株、工作菌株與質控菌株的篩選和鑒定方法有哪些?
小楊 / 2025-09-02 10:59:54

 

百歐博偉生物:標準菌株、工作菌株與質控菌株的篩選和鑒定,需圍繞其核心定位(標準性、實用性、質控有效性)展開 —— 標準菌株側重“權威溯源與原始特性保留”,工作菌株側重 “功能穩(wěn)定與生產 / 研究適配性”,質控菌株側重“性能達標與檢測重復性”。兩者的方法既有共性(如身份確認),也有針對各自需求的特殊步驟,具體可分為篩選方法和鑒定方法兩大類,結合菌株類型差異解析如下:
 
一、篩選方法:根據菌株功能定位,篩選“符合場景需求”的菌株
 
篩選的核心是“從候選菌株中篩選出滿足特定目標的菌株”,不同菌株的篩選邏輯差異顯著,具體如下:
 
(一)標準菌株:以“權威獲取 + 溯源驗證”為主,幾乎不涉及“主動篩選”
 
標準菌株的核心價值是“作為行業(yè)基準”,其來源必須是國際 / 國家權威保藏機構(而非自主篩選),篩選環(huán)節(jié)更多是“對獲取的標準菌株進行合規(guī)性驗證”,確保其未被污染、特性未退化。
 
核心步驟:
 
權威機構獲?。簭墓J保藏機構購買,獲取時需確認菌株編號(如 ATCC 25922,大腸桿菌標準株)、保藏狀態(tài)(凍干 / 斜面)、說明書(含特性描述、保存條件);
 
溯源驗證:核對菌株編號與機構數據庫信息,確認無編號錯誤或信息不符;
 
純度檢查:將菌株復蘇后,通過“純培養(yǎng)驗證”(如劃線接種到平板,觀察菌落形態(tài)是否單一,無雜菌菌落),排除運輸或復蘇過程中的污染。
 
關鍵原則:標準菌株不可“自主篩選”,必須依賴權威來源,避免因菌株來源不明確導致“基準失效”。
 
(二)工作菌株:以“功能適配性 + 穩(wěn)定性”為核心,兼顧安全性
 
工作菌株需滿足“特定應用場景需求”,篩選需從“功能、穩(wěn)定性、安全性”三方面切入,來源可分為“標準菌株傳代衍生”或“自然環(huán)境 / 樣本中篩選”。
 
核心步驟(以工業(yè)發(fā)酵用工作菌株為例):
 
候選菌株來源:
 
方式 1:從標準菌株傳代(如將 ATCC 10231 的釀酒酵母標準株傳代,篩選生長更快的菌株作為工作株);
 
方式 2:從自然樣本篩選(如從腐乳中篩選產蛋白酶的毛霉,從土壤中篩選產纖維素酶的芽孢桿菌);
 
功能篩選(核心):針對目標功能設計篩選方案,如:
 
發(fā)酵菌株:測定候選菌株的“產物產量”(如釀酒酵母的乙醇產率、青霉素菌株的青霉素效價)、“底物利用率”(如葡萄糖轉化效率);
 
降解菌株:測定對目標污染物的降解率(如假單胞菌對石油烴的降解率);
 
科研用菌株:篩選 “生長速度快“易培養(yǎng)”的菌株(如大腸桿菌衍生株,適合分子克?。?;
 
穩(wěn)定性篩選:
 
多次傳代驗證:將候選菌株連續(xù)傳代 10-20 代,每代檢測核心功能(如產率、降解率),篩選“功能衰減≤5%” 的穩(wěn)定菌株(避免傳代后突變導致功能丟失);
 
保存穩(wěn)定性驗證:將菌株凍干或 - 80℃冷凍保存 3-6 個月,復蘇后檢測功能,確保保存后特性不變;
 
安全性篩選:排除致病、產毒風險,如:
 
食品用菌株:檢測是否產毒素(如金黃色葡萄球菌產腸毒素)、是否為致病菌(如沙門氏菌、李斯特菌);
 
工業(yè)用菌株:確認無環(huán)境風險(如不產生有害代謝物、不破壞生態(tài))。
 
(三)質控菌株:以“性能達標 + 重復性”為核心,篩選“符合檢測標準”的菌株
 
質控菌株的核心需求是“能穩(wěn)定驗證檢測方法的有效性”(如陽性對照、靈敏度驗證),篩選需嚴格對標行業(yè)標準,確保其性能參數(如藥敏敏感率、生化反應一致性)符合要求。
 
核心步驟:
 
候選菌株來源:多從標準菌株傳代(如將 ATCC 25922 大腸桿菌標準株作為候選,篩選藥敏質控株),或從權威機構直接購買“預認證質控菌株”;
 
性能指標篩選(核心):針對具體檢測場景,篩選性能達標的菌株,如:
 
藥敏試驗質控株:需滿足“抑菌圈直徑 / 最小抑菌濃度(MIC)在標準范圍”,篩選時需重復測定 3-5 次,確保結果波動≤10%;
 
無菌檢查質控株:需滿足“在特定培養(yǎng)基上生長良好,且不污染其他菌株”(如銅綠假單胞菌 ATCC 9027 在營養(yǎng)瓊脂上 24 h 內形成綠色菌落,無雜菌);
 
生化鑒定質控株:需滿足“生化反應 100% 符合標準”(如大腸桿菌質控株應發(fā)酵乳糖、葡萄糖產酸產氣,不產 H?S);
 
重復性篩選:不同批次、不同操作人員、不同時間檢測,驗證菌株性能的一致性(如連續(xù) 10 批次檢測,藥敏 MIC 均在標準范圍);
 
穩(wěn)定性篩選:短期(1 個月)和長期(6 個月)保存后,復蘇檢測性能,確保無明顯變化(如凍干保存后,抑菌圈直徑變化≤1 mm)。
 
二、鑒定方法:確認菌株“身份正確 + 特性達標”,三類菌株通用核心方法
 
鑒定的目的是“明確菌株的分類地位”和“驗證核心特性是否符合要求”,三類菌株的鑒定方法存在共性(如分子鑒定是金標準),但需結合自身定位補充針對性驗證,具體可分為表型鑒定、分子鑒定、功能特性驗證三大層次,層層遞進確保準確性。
 
(一)基礎層:表型鑒定(形態(tài) + 生化,快速初步確認)
 
通過菌株的“外在形態(tài)”和“代謝特性”初步判斷身份,適合快速篩查,是鑒定的第一步。
 
鑒定類別       核心方法       適用場景與示例
 
形態(tài)學鑒定  菌落形態(tài)觀察:接種到標準培養(yǎng)基,觀察菌落大小、顏色、邊緣、質地、是否產色素;顯微鏡觀察:革蘭氏染色、乳酸酚棉藍染色,觀察細胞形態(tài)、排列方式。  金黃色葡萄球菌:營養(yǎng)瓊脂上形成金黃色圓形菌落,革蘭氏陽性球菌,呈葡萄狀排列;大腸桿菌:麥康凱瓊脂上形成紅色菌落,革蘭氏陰性短桿菌。
 
生化特性鑒定  使用生化反應管或自動化生化鑒定系統(tǒng),檢測菌株對碳源、氮源的利用能力。 沙門氏菌:不發(fā)酵乳糖,產 H?S,脲酶陰性;  銅綠假單胞菌:氧化酶陽性,能利用檸檬酸鹽,產綠膿素。
 
(二)核心層:分子鑒定(基因層面,金標準,確保身份唯一)
 
通過檢測菌株的“基因序列”,從分子層面精準確認分類地位,避免表型相似導致的誤判,是三類菌株鑒定的必需步驟(尤其是標準菌株,需 100% 匹配權威序列)。
 
常用方法:
 
16S rRNA 基因測序(細菌 / 古菌):
 
原理:16S rRNA 基因是細菌的 “進化保守基因”,不同物種的序列存在特異性差異,通過測序并與數據庫中標準菌株的序列對比,同源性≥99% 可判定為同一物種;
 
示例:鑒定一株“疑似大腸桿菌”,測序其 16S rRNA 基因,與 ATCC 25922(大腸桿菌標準株)的序列同源性達 99.8%,可確認其為大腸桿菌。
 
ITS 測序(真菌):
 
原理:ITS(內轉錄間隔區(qū))是真菌核糖體 RNA 基因的非編碼區(qū),進化速度快,物種特異性強,是真菌鑒定的金標準;
 
示例:鑒定一株“疑似釀酒酵母”,測序 ITS 序列,與釀酒酵母標準株(ATCC 10231)同源性≥99%,可確認身份。
 
特異性基因檢測(針對特定特性):
 
目的:驗證菌株是否攜帶關鍵功能基因(如耐藥基因、產毒基因),確保特性達標;
 
示例:
 
質控菌株(耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 MRSA):需檢測是否攜帶 mecA 基因(耐藥關鍵基因),通過 PCR 擴增 mecA 基因,陽性則確認其耐藥特性;
 
致病菌標準菌株(大腸桿菌 O157:H7):需檢測 stx1/stx2 基因(產志賀毒素基因),確保其致病特性。
 
全基因組測序(WGS,高階鑒定):
 
適用場景:標準菌株的精準溯源、質控菌株的深度特性驗證(如確認無未知突變);
 
優(yōu)勢:可獲取菌株的全部基因信息,不僅能確認分類地位,還能分析耐藥基因、代謝通路、毒力基因等,是目前最精準的鑒定方法(如 ATCC 菌株均提供全基因組序列,可用于對比驗證)。
 
(三)應用層:功能特性驗證(針對工作 / 質控菌株,確保“能用、好用”)
 
表型和分子鑒定確認“身份正確”后,需結合菌株的應用場景,驗證其核心功能是否符合需求 —— 這是工作菌株和質控菌株的關鍵鑒定步驟(標準菌株需驗證原始特性是否保留)。
 
工作菌株的功能驗證:
 
發(fā)酵菌株:測定產物產量(如釀酒酵母的乙醇產率≥10%)、發(fā)酵周期(如 24 h 內完成發(fā)酵);
 
酶制劑菌株:測定酶活性(如纖維素酶菌株的酶活≥50 U/mL);
 
益生菌菌株:測定活菌數(如雙歧桿菌工作株的活菌數≥10? CFU/g)、耐酸性(模擬胃酸環(huán)境后活菌存活率≥80%)。
 
質控菌株的功能驗證:
 
藥敏質控株:按 CLSI 標準測定 MIC 或抑菌圈直徑,確保在標準范圍(如 ATCC 25922 對氨芐西林的 MIC 應為 2-8 μg/mL);
 
無菌檢查質控株:接種到無菌檢查用培養(yǎng)基(如硫乙醇酸鹽流體培養(yǎng)基),24-48 h 內觀察生長情況,確保 “生長旺盛且無雜菌”;
 
生化質控株:使用標準生化管驗證所有關鍵反應(如大腸桿菌質控株需 100% 發(fā)酵乳糖、葡萄糖,不發(fā)酵蔗糖)。
 
標準菌株的特性驗證:
 
復蘇后需驗證其 “原始標準特性”(如 ATCC 6538 金黃色葡萄球菌,需驗證其產生金黃色色素、凝固酶陽性、溶血性陽性),確保與權威機構說明書一致,無特性丟失。
 
三、三類菌株篩選與鑒定的核心差異總結
 
維度     標準菌株     工作菌株    質控菌株
 
篩選核心 權威來源 + 溯源驗證 功能適配性 + 傳代穩(wěn)定性 + 安全性 性能達標+ 檢測重復性
 
鑒定重點 身份精準性+ 原始特性保留 身份正確 + 核心功能達標 身份正確 + 性能參數 100% 符合標準
 
關鍵標準 權威機構說明書 生產/研究需求標準 行業(yè)檢測標準
 
總結
 
篩選和鑒定的邏輯可概括為:“篩選選‘合適的’,鑒定定‘正確的’”—— 篩選是從候選菌株中挑出滿足場景需求的“潛力株”,鑒定是通過表型、分子、功能三層驗證,確認其 “身份無誤、特性達標”。
 
標準菌株是“基準”,核心在“權威溯源”;
 
工作菌株是“工具”,核心在“功能穩(wěn)定”;
 
質控菌株是“標尺”,核心在“性能精準”。
 
三者的方法均需圍繞自身定位,確保最終菌株能滿足“標準化、可重復、可控化”的應用需求。
 
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