前 言
本規(guī)范由國(guó)家自然科技資源平臺(tái)建設(shè)項(xiàng)目提出。
本規(guī)范起草單位:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院土壤肥料研究所、中國(guó)科學(xué)院微生物研究所、中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院森林保護(hù)研究所、中國(guó)藥品生物制品檢定所、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所、中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所、中國(guó)食品發(fā)酵工業(yè)研究院。
本規(guī)范主要起草人:田國(guó)忠、李永、樸春根、姜瑞波、顧金剛、周宇光、葉強(qiáng)、張?jiān)虑佟㈥惷?、程池等?br />
引 言
植原體是一類(lèi)無(wú)細(xì)胞壁的原核微生物,能侵染包括農(nóng)作物、林木、花卉、雜草等植物,給農(nóng)、林業(yè)生產(chǎn)帶來(lái)巨大損失,近年來(lái),此類(lèi)病害在某些重要植物處于蔓延和加重的趨勢(shì)。這類(lèi)微生物尚不能在人工培養(yǎng)基上離體培養(yǎng),其細(xì)胞結(jié)構(gòu)、與寄主植物的互作等方面也有其明顯不同特點(diǎn),是基礎(chǔ)和應(yīng)用研究的重要材料。
研究制訂植原體菌種資源描述規(guī)范,有利于有效整理和保藏全國(guó)植原體菌種資源,整合菌種信息資源,達(dá)到植原體菌種資源的高效共享和可持續(xù)利用的目的。
植原體菌種資源描述規(guī)范
1 范圍
本規(guī)范規(guī)定了植原體菌種資源描述要素和描述規(guī)范。
本規(guī)范適用于植原體菌種資源的收集、整理、保藏,以及數(shù)據(jù)庫(kù)和信息共享網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)的建立。
2 規(guī)范性引用文件
下列文件中的條款通過(guò)本規(guī)范的引用而成為本規(guī)范的條款。凡是注日期的引用文件,其隨后所有的修改單(不包括勘誤的內(nèi)容)或修訂版均不適用于本規(guī)范,然而,鼓勵(lì)根據(jù)本規(guī)范達(dá)成協(xié)議的各方研究是否可使用這些文件的最新版本。凡是不注日期的引用文件,其最新版本適用于本規(guī)范。
GB 19489 實(shí)驗(yàn)室 生物安全通用要求
國(guó)務(wù)院令第424號(hào)《病原微生物實(shí)驗(yàn)室生物安全管理?xiàng)l例》
科技部自然科技資源平臺(tái)聯(lián)合管理辦公室文件《自然科技資源共性描述規(guī)范(試行)》
3 術(shù)語(yǔ)、定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本規(guī)范。
植原體 phytoplasma
指寄生于植物韌皮部篩管和介體昆蟲(chóng)體內(nèi)的、具有三層單位膜結(jié)構(gòu)的無(wú)細(xì)胞壁的原核生物。一般引起植物葉片黃化和發(fā)育畸形等癥狀。
4 要求
4.1 描述要求:
描述內(nèi)容應(yīng)清楚、準(zhǔn)確,力求完整。
要充分考慮該菌株的最新研究進(jìn)展;
能被微生物專業(yè)人員理解。
4.2 描述要素
描述要素分為2類(lèi):
M:必備要素,必須描述的要素。
O:可選要素,其描述與否視具體菌株而定。
5 描述內(nèi)容
5.1 基本信息
1. 學(xué)名(M)
應(yīng)指明該菌株完整的科學(xué)名稱。
2. 中文名稱(M)
應(yīng)指明該菌株的中文名稱(如有別名,可在括號(hào)中注明)。尚無(wú)中文譯名時(shí),填寫(xiě)“暫無(wú)”。
3. 資源歸類(lèi)編碼(M)
應(yīng)指明該菌株的資源歸類(lèi)編碼,參見(jiàn)《自然科技資源共性描述規(guī)范(試行)》。
4. 菌株保藏編號(hào)(M)
應(yīng)指明該菌株在專業(yè)保藏機(jī)構(gòu)的保藏編號(hào),保藏編號(hào)由前綴和菌株編號(hào)兩部分組成。前綴為保藏機(jī)構(gòu)英文名稱的縮寫(xiě),前綴和菌株編號(hào)之間應(yīng)留空格。
5. 其它中心編號(hào)(O)
宜指明該菌株在其它菌種保藏機(jī)構(gòu)的菌株保藏編號(hào)。每個(gè)其它保藏機(jī)構(gòu)的編號(hào)均由“=”開(kāi)頭,如編號(hào)不止一個(gè)時(shí),中間也用“=”連接。
6. 來(lái)源歷史(M)
應(yīng)指明得到該菌株的途徑。如菌株轉(zhuǎn)移經(jīng)過(guò)多個(gè)保藏機(jī)構(gòu),則保藏機(jī)構(gòu)之間用一個(gè)左指向的箭頭“←”連接。
7. 分離人(M)
應(yīng)指明該菌株最初分離人的姓名。
8. 分離時(shí)間(M)
應(yīng)指明該菌株的分離時(shí)間。
9. 原始編號(hào)(M)
應(yīng)指明該菌株最初分離編號(hào)。
10. 鑒定人(O)
宜指明該菌株的鑒定人。
11. 鑒定人所在單位(O)
宜指明該菌株的鑒定人所在單位。
12. 收藏時(shí)間(O)
宜指明保藏機(jī)構(gòu)收集、保藏該菌株的時(shí)間。
13. 原產(chǎn)國(guó)或地區(qū)(M)
應(yīng)指明該菌株分離基物采集地所在國(guó)家或地區(qū)的名稱。
14. 采集地區(qū)(O)
宜指明該菌株采集地的行政區(qū)劃,詳細(xì)到縣。
15. 分離基物(O)
宜指明具體的分離基物名稱。
16. 采集地生境(O)
宜描述該菌株分離基物具體采集地點(diǎn)的生態(tài)環(huán)境,參照《微生物菌種資源采集環(huán)境描述規(guī)范(試行)》。
17. 生物危害等級(jí)(M)
應(yīng)指明該菌株的生物危害等級(jí):Ⅰ級(jí)、Ⅱ級(jí)、Ⅲ級(jí)、Ⅳ級(jí)。
18. 培養(yǎng)基(M)
應(yīng)指明該菌株的培養(yǎng)基及配方。
19. 模式菌株(M)
凡是模式菌株應(yīng)予指明。
20. 分類(lèi)地位 (M)
應(yīng)指明每個(gè)菌株的界、門(mén)、綱、目、科、屬、候選種(組)、亞組。
21. 菌種用途 (O)
宜指明菌株已知的主要用途及功能特性。
22. 致病對(duì)象 (O)
宜指明病原菌種的致病對(duì)象及其病害名稱。
23. 寄主名稱 (O)
宜指明菌種寄生宿主的學(xué)名和中文名稱。
5.2 特征特性信息
24. 菌體形態(tài)和大?。∣)
宜指明該菌株電鏡下的菌體大小、形狀等。
25. 植原體-植物共生體培養(yǎng)特征(O)
宜指明該菌株與寄主植物共生過(guò)程中的培養(yǎng)特征,并指出培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件。
26. 生理生化特征(O)
宜指明該菌株對(duì)抗生素的敏感性、血清學(xué)反應(yīng)等生理生化特征。
27. 16S rDNA序列(O)
宜指明該菌株16S rRNA基因的序列信息,核苷酸注冊(cè)號(hào)。
28. 核糖體蛋白基因序列(O)
宜指明該菌株核糖體蛋白基因序列信息,核苷酸注冊(cè)號(hào)。
29. DNA 堿基組成(G+C)mol% 分析(O)
宜指明該菌株DNA的G+C mol%含量。
30. 23S rDNA序列(O)
宜指明該菌株23S rRNA基因序列信息,核苷酸注冊(cè)號(hào)。
31. 16SrDNA和23SrDNA間區(qū)序列(O)
宜指明16SrDNA和23SrDNA間區(qū)(16S-23S ribosomal DNA sace region)序列信息、核苷酸注冊(cè)號(hào)。
5.3 其它信息
32. 圖像信息(O)
宜給出該菌株電鏡下的形態(tài)及植原體-植物共生體等圖象信息。
33. 文獻(xiàn)信息(O)
宜列出該菌株公開(kāi)發(fā)表的文獻(xiàn)資料。
34. 保藏方法 (M)
應(yīng)指明該菌株適合長(zhǎng)期保藏采用的技術(shù)方法。
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