生物菌肥根據(jù)其作用不同，可分為以下5類：
1、有固氮作用的菌肥：包括根瘤菌、固氮菌、固氮藍藻等；
2、分解土壤有機物的菌肥：包括有機磷細菌和復合細菌等；
3、分解土壤中難溶性礦物的菌肥：包括硅酸鹽細菌、無機磷細菌等；
4、促進作物對土壤養(yǎng)分利用的菌肥：包括菌根菌等；
5、抗病及刺激作物生長的菌肥：包括抗生菌、增產(chǎn)菌等。
幾種常見的菌肥及其作用
1、枯草芽孢桿菌：增加作物抗逆性、固氮。
2、巨大芽孢桿菌：解磷(磷細菌)，具有很好的降解土壤中有機磷的功效。
3、膠凍樣芽孢桿菌：解鉀，釋放出可溶磷鉀元素及鈣、硫、鎂、鐵、鋅、鉬、錳等中微量元素。
4、地衣芽孢桿菌：抗病、殺滅有害菌，
5、蘇云金芽孢桿菌：殺蟲(包括根結線蟲)，對鱗翅目等節(jié)肢動物有特異性的毒殺活性。
6、側孢芽孢桿菌：促根、殺菌及降解重金屬，
7、膠質芽孢桿菌：有溶磷、釋鉀和固氮功能，分泌多種酶，增強作物對一些病害的抵抗力。
8、涇陽鏈霉菌：具有增強土壤肥力、刺激作物生長的能力。
9、菌根真菌：擴大根系吸收面，增加對原根毛吸收范圍外的元素(特別是磷)的吸收能力。
10、棕色固氮菌：固定空氣中的游離氮，增產(chǎn)。
11、光合菌群：是肥沃土壤和促進動植物生長的主力部隊。
12、凝結芽孢桿菌：可降低環(huán)境中的氨氣、硫化氫等有害氣體。提高果實中氨基酸的含量。
13、米曲霉：使秸稈中的有機質成為植物生長所需的營養(yǎng)，提高土壤有機質，改善土壤結構。
14、淡紫擬青霉：對多種線蟲都有防治效能，是防治根結線蟲最有前途的生防制劑。