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微生物基因——藥物研發(fā)新“礦脈”!
小楊 / 2023-03-06 08:40:15


百歐博偉生物:報(bào)道稱,從自然界微生物生成的天然物質(zhì)中出現(xiàn)了很多醫(yī)藥產(chǎn)品。迄今為止,微生物中的基因只有一部分可用于藥物開發(fā),但隨著基因組解析的進(jìn)步,新的“礦脈”正在不斷涌現(xiàn)。尋找新藥候選對象的“微生物淘金熱”時(shí)代會(huì)到來嗎?

微生物所帶來新藥的鼻祖是抗生素“青霉素”,英國的亞歷山大·弗萊明發(fā)現(xiàn)了它,并因此于1945年獲得諾貝爾獎(jiǎng)。2015年獲得諾貝爾獎(jiǎng)的大村智,則是在高爾夫球場附近的土壤中發(fā)現(xiàn)了用以開發(fā)出抗寄生蟲藥“伊維菌素”的微生物。

如果找到可以生成天然物質(zhì)的基因,就可以將其加入到其他微生物中,合成為效果更好的天然物質(zhì)。微生物的基因組是新藥的礦脈,現(xiàn)在大約半數(shù)的醫(yī)藥品都是以天然物質(zhì)為基礎(chǔ)的。

但是近年來,僅靠以往的培養(yǎng)法和解析技術(shù),已經(jīng)找不到比過去更好的微生物了。

新藥開發(fā)的方法,除了利用微生物產(chǎn)生的天然物質(zhì),還有以人工合成促進(jìn)人體活動(dòng)的物質(zhì)。由于難以找到天然物質(zhì),制藥公司正將研發(fā)重心轉(zhuǎn)移到使用人類抗體等的生物藥品上。

然而,東京大學(xué)教授大西康夫指出,“微生物還蘊(yùn)含著很多可能性”,只是沒有挖掘出未知的基因。在已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的微生物中,只有20%左右的基因發(fā)揮了作用,剩下的80%還處于休眠狀態(tài),無法得知其功能。

大西教授關(guān)注的是喚醒未知基因的“基因組挖掘”技術(shù)。未知基因一旦轉(zhuǎn)移到其他微生物身上,往往就會(huì)從休眠狀態(tài)被喚醒。這樣一來,就可以合成以前無法獲得的新天然物質(zhì)。

藥品的藥效由化合物的結(jié)構(gòu)決定。微生物生成的天然物質(zhì)有多種結(jié)構(gòu)。如果運(yùn)用“基因組挖掘”技術(shù),將有助于開發(fā)出治療頑疾的新藥。

東北大學(xué)教授淺井禎吾將在絲狀菌中休眠的一部分基因轉(zhuǎn)移到曲霉菌中,產(chǎn)生出22種天然產(chǎn)物,在防止引發(fā)老年癡呆癥蛋白質(zhì)的凝聚、防止引發(fā)癌癥干細(xì)胞的增加方面具有一定效果。淺井教授說,這意味著“將出現(xiàn)爭奪新基因組的競爭”。

應(yīng)該還存在未被人類見過的微生物。但自然界的微生物在人類所提供的環(huán)境中很難繁殖,因此很難分析其基因組。也可以說,現(xiàn)在手邊的微生物基因組只是偶然培養(yǎng)出來的種類。

隨著快速讀取遺傳基因堿基序列的“新一代測序儀”的出現(xiàn),各種生物的基因組被解析出來,但地球的微生物基因組得到解析的還不到1%。

早稻田大學(xué)的創(chuàng)業(yè)公司bitBiome開發(fā)出了將每個(gè)微生物封閉在一滴液體中,進(jìn)而讀取其基因組的獨(dú)有技術(shù)。即使培養(yǎng)過程很困難,也能找到遺傳基因。

公司創(chuàng)始人細(xì)川正人說:“希望充分利用龐大而未被利用的微生物資源?!睋?jù)介紹,該公司以每月1億個(gè)的速度解析微生物基因組,已建立了8億個(gè)基因的數(shù)據(jù)庫。這成為探索目標(biāo)基因的“地圖”。這些基因獵手共同的最終目標(biāo)是開發(fā)出“自動(dòng)挖掘礦脈”的技術(shù)。如果能用人工智能和機(jī)器人探索出微生物基因組生成的天然物質(zhì),那將進(jìn)一步加快利用天然物質(zhì)的藥物研發(fā)。淺井教授也認(rèn)為這“在技術(shù)上完全有可能實(shí)現(xiàn)”。

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