一、背景
放線菌屬通用PCR試劑盒是即用型PCR試劑盒的改良產(chǎn)品，含有Taq DNA聚合酶、dNTPs、MgCl2、反應(yīng)緩沖液、PCR增強(qiáng)劑、上樣染料等所有PCR所需要的成分，用戶只需加入放線菌模板和放線菌引物即可進(jìn)行PCR反應(yīng)，具有廣泛的用途。
放線菌(Actinomyces spp.)在自然界分布廣泛，主要以孢子或菌絲狀態(tài)存在于土壤、空氣和水中，尤其是含水量低、有機(jī)物豐富、呈中性或微堿性的土壤中數(shù)量最多。放線菌是一類極其重要的微生物資源。放線菌與人類的生產(chǎn)和生活關(guān)系極為密切，廣泛應(yīng)用的抗生素約70%是各種放線菌所產(chǎn)生。一些種類的放線菌還能產(chǎn)生各種酶制劑（蛋白酶、淀粉酶、和纖維素酶等）、維生素（B12）和有機(jī)酸等。此外，放線菌還可用于甾體轉(zhuǎn)化、烴類發(fā)酵、石油脫蠟和污水處理等方面。少數(shù)放線菌也會對人類構(gòu)成危害，引起人和動植物病害。因此，放線菌與人類關(guān)系密切，在醫(yī)藥工業(yè)上有重要意義，檢測放線菌具有重要的意義。
二、放線菌屬通用PCR試劑盒特點(diǎn)
1、即開即用，用戶只需要提供樣品DNA模板。
2、根據(jù)放線菌保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物和探針，能專一性地檢測出樣品中的放線菌。
3、提供陽性對照，便于區(qū)分假陰性樣品。
4、一管式閉管操作，降低了交叉污染。
5、本產(chǎn)品只能用于科研，足夠50次20μL體系的熒光定量PCR。
三、應(yīng)用
放線菌屬通用PCR試劑盒可以用于螞蟻內(nèi)共生放線菌的鑒定及抗菌活性產(chǎn)物研究：
近年來科學(xué)家們在探尋新型抗生素的篩選途徑時,發(fā)現(xiàn)昆蟲內(nèi)生菌能夠產(chǎn)生許多種類多樣的次生代謝產(chǎn)物,尤其那些能夠幫助宿主抵御病原菌入侵的放線菌,其中一些具有新穎的結(jié)構(gòu)并表現(xiàn)出較好的生物活性。由于這些化合物能夠存在于真核宿主體內(nèi),且不危害宿主,所以它們很有可能對人類也沒有毒副作用。因此這些昆蟲內(nèi)生放線菌具有很大產(chǎn)生人類藥用的抗生素潛力,所以近年來昆蟲內(nèi)共生放線菌受到越來越多科學(xué)家的關(guān)注,昆蟲內(nèi)生放線菌也將是持續(xù)地發(fā)現(xiàn)新抗生素的重要領(lǐng)域之一,這對于對抗日益增多的抗藥病原菌和新型疾病具有重要意義。
以實(shí)驗(yàn)室篩選得到的30株螞蟻內(nèi)生菌為材料,通過培養(yǎng)特征觀察、抗菌活性測試和16S rRNA序列測序結(jié)果分析,發(fā)現(xiàn)兩株潛在的放線菌新種3H-GS17T和2H-TWYE14T和一株具有良好抗菌活性放線菌1H-GS2,對它們分別進(jìn)行了系統(tǒng)的分類學(xué)鑒定和活性物質(zhì)的分離鑒定,結(jié)果如下:
(1)16S rRNA分析結(jié)果顯示菌株3H-GS17T是珊瑚放線菌屬的一株菌,與Actinocorallia glomerata JCM 9376T(98.13%)和Actinocorallia longicatena JCM 9377T(97.64%)的16S rRNA序列相似性最高?；瘜W(xué)分類學(xué)特征也與Actinocorallia的特征一致。而DNA–DNA雜交結(jié)果和表型分析結(jié)果顯示菌株3H-GS17T明顯不同于與它相近的菌株,進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)證明菌株3H-GS17T和珊瑚放線菌屬的其他菌株都不相同。因此確定菌株3H-GS17T是珊瑚放線菌屬的一個新種,命名為Actinocorallia lasicapitis,典型菌株是3H-GS17T(=DSM 100595T=CGMCC4.7282T)。
(2)16S rRNA分析結(jié)果顯示2H-TWYE14T是鏈霉菌屬的一株菌,與Streptomyces niveus NRRL 2466T(98.84%)的16S rRNA序列相似性最高。gyr B基因分析結(jié)果同樣顯示2H-TWYE14T屬于鏈霉菌屬?；瘜W(xué)分類學(xué)特征也與鏈霉菌屬的其他菌株相一致。而2H-TWYE14T與S.niveus NRRL 2466T之間的DNA–DNA雜交結(jié)果和表型分析結(jié)果顯示2H-TWYE14T明顯不同于S.niveus NRRL 2466T。因此確定菌株2H-TWYE14T是鏈霉菌菌屬的一個新種,命名為Streptomyces camponoticapitis,典型菌株是2H-TWYE14T(=DSM 100523T=CGMCC 4.7275T)。
(3)活體生物活性檢測顯示菌株1H-GS2對部分測試真菌具有較好的生物活性,將菌株進(jìn)行發(fā)酵,發(fā)酵產(chǎn)物同樣顯示良好的真菌抑制活性。對發(fā)酵產(chǎn)物中的化合物進(jìn)行分離純化后,利用現(xiàn)代光譜學(xué)進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析鑒定,最終得到化合物白諾菌素(Albonoursin)。
為了更好的服務(wù)社會，創(chuàng)造雙方利益最大化，我們特設(shè)了微生物菌種查詢網(wǎng)（www.family998.com）！專業(yè)為各企事業(yè)單位，科研院所，各級學(xué)校提供微生物菌種產(chǎn)品查詢、購買服務(wù)！網(wǎng)站主要提供的產(chǎn)品：質(zhì)控菌種，標(biāo)準(zhǔn)菌種，中國微生物菌種4萬多株，細(xì)胞系/株1萬多株其中金黃色葡萄球菌，大腸埃希氏菌（大腸桿菌），沙門氏菌，黑曲霉，銅綠假單胞菌，枯草芽孢桿菌，鏈球菌，白色念珠菌，志賀氏菌等為常用菌株。